長春市兒童醫院藥劑科是集執行藥政法律、法規，藥品管理與供應，臨床藥學服務為一體的綜合性技術部門。 現有藥學技術人員38人，其中主任藥師4人、副主任藥師14人、主管藥師8人、藥師（藥士）12人。其中碩士5人，大學本科23人。 藥劑科負責組織實施中、西藥的調劑，醫院制劑生產，藥品采購供應及藥品質量控制等藥事管理工作，有完善的工作制度，積極推行規范化、法制化、目標化、現代化管理模式。貫徹執行吉林省藥品集中招標采購工作，努力提高藥品質量，降低藥品價格，以確保病人用藥的經濟、安全、有效。同時藥劑科還擔負全院藥學實踐工作。

藥劑科下設臨床藥學、藥品采購供應組、藥品調劑組、中藥制劑等部門，各部門向全院提供藥學特色服務：

1.藥品調劑組包括 門診藥房、住院藥房、夜診藥房、感染藥房、中藥房，肩負全院患者的藥品調劑工作，負責指導患者合理應用藥品，如用藥交代，用藥咨詢等。配合臨床對住院病人在治療期間的藥物監護，確保臨床用藥安全、合理、有效。

2.采購供應組負責全院現有600余品規藥品采購、藥品驗收與儲藏養護、藥品供應、藥品微機系統維護、藥品核算等，有嚴格的藥品管理制度。

3.臨床藥學 負責藥品不良反應的收集上報，耐藥菌監測，開展藥物咨詢服務，定期更新《用藥指南》欄目內容,為患者和臨床提供藥物信息和合理用藥依據，臨床藥師及時向醫務人員介紹藥學領域的新知識、新成果、新技術、新方法、迅速反映醫院藥品使用及管理情況，深入臨床配合醫生加強合理用藥，指導患者用藥。每季出版一期《臨床藥訊》。

4 中藥制劑室 堅持以滿足臨床需要為中心，基礎研究與藥學臨床應用相結合的藥學研究模式，在制劑方面積累了豐富臨床經驗。已有多種醫院制劑產品在臨床應用，療效確切，受到患者認可，創造了良好社會效益。